Le rapport d’activités 2012 du Plan Bleu présente une évaluation complète des interactions entre l’environnement et le développement en Méditerranée. La structure de ce rapport reprend le cadre logique du Plan d’action pour la Méditerranée (PAM) qui a été convenu par les 21 pays et l’Union européenne lors de la conférence des Parties à la Convention de Barcelone à Marrakech en 2009. Ce cadre est commun à l’unité de coordination basée à Athènes et aux centres d’activités régionales et répartit les activités en 6 thèmes. Le caractère transversal du Plan Bleu est bien illustré par le fait que ses activités se répartissent sur 5 de ces 6 thèmes : gouvernance, gestion intégrée des zones côtières, biodiversité, consommation et production durable et changement climatique. Le sixième thème (prévention et maîtrise de la pollution des eaux marines) n’est pas ignoré par le Plan Bleu puisque certaines activités (indicateur, eau) abordent indirectement ce sujet.